A tizenkét élvonalbeli csapatot (a nemzetközi porondon érdekelt Debreceni VSC-TEVA, Újpest FC, Szombathelyi Haladás és Budapest Honvéd csak februárban, a középdöntők során kapcsolódik be) két csoportra osztották, mindkettőből az első két helyezett jut tovább. Az A-csoportba a Kecskemét, az MTK, a Diósgyőr, a Vasas, a Nyíregyháza és a Ferencváros, a B-be pedig a Paks, a Győr, a Zalaegerszeg, a Fehérvár, a Kaposvár és a Pápa került.
A csoportmérkőzések július 22-én kezdődnek, s az év végéig tartanak, a középdöntők - amelyekbe már a négy kupacsapat is bekapcsolódik - februárban veszik kezdetüket.
2010. február 24-én hazai pályán játssza első Ligakupa-meccsét a vasi gárda. Az első ellenfél az A-csoport első helyezettje lesz. Március 3-án a B jelű kvartett másodikjának vendégeként lép fűre a Hali, majd március 10-én Újpest-Haladás mérkőzés lesz. A csoportkör "visszavágói" március 17-én, 24-én és 31-én lesznek, míg a döntő, ahol az A és B négyes első helyezettje csap össze, április 28-án.
